Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

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Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Strn3Q9ERG2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Strn3Q9ERG2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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