Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall1Q9ER74 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms