Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clstn2Q9ER65 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms