Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp3a44Q9EQW4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp3a44Q9EQW4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp3a44Q9EQW4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp3a44Q9EQW4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp3a44Q9EQW4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp3a44Q9EQW4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp3a44Q9EQW4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp3a44Q9EQW4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms