Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tlr9Q9EQU3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr9Q9EQU3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms