Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndst3Q9EQH7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ndst3Q9EQH7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Ndst3Q9EQH7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Ndst3Q9EQH7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndst3Q9EQH7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms