Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3bpQ9EQG9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms