Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms