Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rpgrip1Q9EPQ2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms