Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap3s1Q9DCR2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms