Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg8Q9DBM0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcg8Q9DBM0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abcg8Q9DBM0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcg8Q9DBM0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms