Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms