Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrmuQ9DAT5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrmuQ9DAT5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms