Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cmtm2aQ9DAR1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms