Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms