Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms