Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms