Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc1Q9D9T8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc1Q9D9T8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc1Q9D9T8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc1Q9D9T8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc1Q9D9T8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc1Q9D9T8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc1Q9D9T8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc1Q9D9T8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms