Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V7

Sec11c, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec11cQ9D8V7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec11cQ9D8V7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec11cQ9D8V7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec11cQ9D8V7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec11cQ9D8V7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec11cQ9D8V7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec11cQ9D8V7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec11cQ9D8V7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec11cQ9D8V7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec11cQ9D8V7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms