Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms