Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8N1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms