Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slc52a2Q9D8F3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc52a2Q9D8F3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms