Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp4bQ9D8B3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms