Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc4Q9D844 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms