Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms