Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp4cQ9D7F7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms