Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Cldn23Q9D7D7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms