Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exosc8Q9D753 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc8Q9D753 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms