Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc81Q9D5W4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms