Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn11Q9D572 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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