Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgms2Q9D4B1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgms2Q9D4B1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms