Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms