Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms