Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx29Q9D3S3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx29Q9D3S3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms