Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms