Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp5Q9D387 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms