Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Krt20Q9D312 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Krt20Q9D312 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Krt20Q9D312 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Krt20Q9D312 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Krt20Q9D312 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Krt20Q9D312 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Krt20Q9D312 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Krt20Q9D312 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Krt20Q9D312 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt20Q9D312 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms