Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
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Trmt44Q9D2Q2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt44Q9D2Q2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Trmt44Q9D2Q2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Trmt44Q9D2Q2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Trmt44Q9D2Q2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Trmt44Q9D2Q2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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Trmt44Q9D2Q2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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Trmt44Q9D2Q2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
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