Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930583I09RikQ9D2E3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms