Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MrnipQ9D1F5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MrnipQ9D1F5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms