Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms