Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc167Q9D162 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc167Q9D162 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc167Q9D162 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc167Q9D162 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc167Q9D162 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc167Q9D162 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc167Q9D162 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc167Q9D162 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc167Q9D162 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc167Q9D162 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms