Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms