Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Exosc7Q9D0M0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc7Q9D0M0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms