Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gtf2e1Q9D0D5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms