Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Polr3eQ9CZT4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Polr3eQ9CZT4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms