Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisa9Q9CZN4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shisa9Q9CZN4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms