Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Utp11Q9CZJ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms