Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms