Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms